無論飼料原料的價格多么昂貴，大豆始終是豬糧中最為經濟的蛋白來源之一。因此，大豆被廣泛用于配制各種豬飼料。然而，同其它大多數飼料原料一樣，大豆也有缺陷。
一、大豆含有大量抗營養因子大豆的主要缺陷問題在于它含有大量抗營養因子。這會降低消化率，最終影響動物的生長和生產效率以及養殖者的收益。即使用大豆飼喂成年豬，有時也會影響消化率，除非經過充分的熱處理，否則，大豆中的這些抗營養因子很難清除。但蒸煮過度又會導致有益蛋白變性，從而違背了蒸煮的首要目的。
因此，我們需要優化加工條件，在維持蛋白品質和降低抗營養因子兩者之間建立平衡關系。這些抗營養因子主要影響仔豬，尤其是斷奶前后的仔豬。那些原本有益的大豆蛋白會引起仔豬的過敏反應，激活仔豬腸道免疫系統，造成機體被病原微生物入侵的假象，從而導致ASIT(變應原特異性免疫治療)現象的發生。這一負面反應會引起炎癥和腹瀉，而炎癥通常會破壞腸道內層，為病原菌的粘附和外毒素的吸收提供便利。盡管在免疫系統停止反應之前，上述整個過程不會超一個星期，但造成的損害則是長期的、多方面的。在通常情況下，都會有病原菌的感染伴隨。
二、業界對大豆使用的2種觀點為了解決大豆抗營養因子對仔豬造成的影響，業界提出兩種觀點：一種提倡在斷奶后立即引入大豆蛋白(假設仔豬在斷奶前沒有或很少接觸教槽料)。盡管人們建議斷奶后應當循序漸進地引入大豆蛋白，但這種觀點要求豆粕在斷奶后第一份日糧中的使用量達10%左右，在第二份日糧中要迅速增至15%，其余依次類推。這種方法需要仔豬具有較高水平的采食量，以確保影響降至最低。當采食量低于維持需要時，大豆蛋白的負面影響則會有加重趨勢。這種方案的優點在于：
1)配方成本低；
2)仔豬適應大豆蛋白快；
3)日糧變化次數少。相比之下，缺點在于腹瀉率高，尤其是在健康狀態并不理想(全球許多地區都存在這種情況)的豬場內。針對同樣的問題，另一個更為溫和的方法，是在斷奶后的第一份日糧中不使用任何大豆產品，在第二份日糧中以煉制品的形式使用少量大豆蛋白(如幾乎不含抗營養因子的大豆分離蛋白)。同第一種方法相似，這種方法的關鍵點也是逐漸適應。不過，兩者的主要區別在于第二種方法將斷奶應激與大豆蛋白問題分開看待。通常，這兩個問題被視為一體；但不管它們之間關系多么密切，它們都明顯不同。第二種方法適用于那些存在健康問題的養殖場，但這樣的日糧價格昂貴，令人難以承受。因此，從市場角度看，這種方法并不理想。
三、大豆使用效果最佳的方法當然，介于這兩種較為極端的方法之間，業界還嘗試采用了許多其它的方法，并在應用過程中取得了不同程度的成功。兩種方法折中具有許多優點，由此配制的日糧對于那些健康狀態不明的豬場最為適用?？偟膩碚f，在作者的親身經歷中，以下六種大豆的應用方法效果最佳：
1.在斷奶后第一份日糧中應該使用某種形式的大豆蛋白(在教槽料中也該使用)，其中，最為理想的形式為全脂膨化大豆。但要獲得加工良好的膨化大豆卻并不容易。在仔豬日糧中，胰蛋白酶抑制劑是衡量大豆質量的最佳指示劑(見圖1)。如果它的含量低于10mg/g，在仔豬日糧中添加高達10%的大豆就沒有任何問題。在特殊情況下，如果胰蛋白酶抑制劑的含量低于5mg/g(對蛋白無分解作用)，大豆在仔豬日糧中的使用量就能高達20%。
2.在沒有膨化大豆或膨化大豆中的胰蛋白酶抑制劑水平不夠低時，另一個最經濟、最恰當的大豆蛋白源為大豆濃縮蛋白(或大豆分離蛋白，視蛋白的單位價格高低而定)。這種原料通常純度很高，在大多數仔豬日糧中添加20%，除增加成本外沒有任何問題。
3.在斷奶后仔豬第一份日糧中，由膨化大豆或大豆分離蛋白所提供的日糧粗蛋白水平不應超過10%。這既可確保免疫系統被充分激活，又可避免免疫系統承載過多大豆蛋白抗原。
4.為使過敏反應降至最低，日糧應易于消化，且盡可能可口。在這一方面，使用免疫球蛋白(來自血漿或卵黃)、魚粉和加熱的谷物有助于提高早期采食量。此外，日糧應該含有適當的抗菌劑。
5.豆粕(48%蛋白含量的豆粕效果最好，因為與44%蛋白含量的豆粕相比，它的纖維含量低)。大體而言，日糧含有10%的豆粕就能保證大豆蛋白的平衡。在這種情況下，隨著消化系統日漸成熟，抗營養因子在斷奶后日糧中的含量逐步提高。同時，免疫系統具有足夠的時間來應對過敏反應。
6.在第三份日糧及所有后續日糧中，只以豆粕作為主要的蛋白源，以降低成本。如果采納上述建議且仔豬采食量足夠高，過敏反應則極不明顯，仔豬可以相安無事地度過。而豬群在最為敏感的任一時期也不會因抗營養因子的存在而大受折磨。
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